Caso os parâmetros estejam todos normais e o defeito apareceu somente na troca da bat, o único conselho que posso te passar é que ande com o carro para que ele faça a auto adaptação, provavelmente ele estava adaptado por muito tempo e perdeu esta configuração.
Tenho um cliente com um Marea 2.0 20V que instalou o kit flex, o carro fica perfeito por uns 3 dias então começa a perder rendimento até chegar á fase de ficar estourando no coletor devido ao empobrecimento, eu aconselhei ele a desligar a bat á noite, toda vez que o defeito começar a incomodar e só religar cedo quando for trabalhar, aconselhei a remover o kit flex mas ele prefere desligar a bat 1 vez por semana, muito companheiro dirá que a memo com sistema fash não aceita apagar defeitos mas pelo menos na adaptação está funcionando.